Введение в биоинформатику: метагеномика
Авторский коллектив курса «Введение в биоинформатику: метагеномика» был отмечен дипломом II степени в номинации «За способность понятно объяснять самые абстрактные идеи» на Международном конкурсе открытых онлайн-курсов EdCrunch Award в 2018 году.
Для кого?
Курс предназначен для тех, кто готов учиться и осваивать передовые знания, необходимые сегодня всем биологам, медикам, экологам и многим другим. Навыки программирования не обязательны, но очень приветствуются. Приглашаются слушатели, начиная с уровня последнего года бакалавриата и далее.
О чем?
Курс посвящен введению в метагеномику и затрагивает основные теоретические и практические подходы анализа видового состава, генетического материала и функционала сообществ микроорганизмов, обитающих в окружающей среде.
По завершении этого курса учащиеся будут:
- Уметь правильно планировать эксперимент; оценивать сложность задач и требуемых для их решения ресурсов (лабораторных и компьютерных); оценивать качество произведенных данных с точки зрения поставленной задачи; правильно выбирать и создавать программные продукты для решения поставленной задачи.
- Знать, какие задачи вызывают необходимость исследования сложных микробных сообществ медиками, биологами, программистами и математиками; программные продукты и аналитические платформы, созданные для работы с метагеномными данными; математические алгоритмы, лежащие в основе таких программ.
- Владеть методами и подходами решения возникающих в ходе работы научных задач.
Авторы курса:
-
Алла Львовна Лапидус
кандидат биологических наук, профессор кафедры цитологии и гистологии, заместитель руководителя лаборатории «Центр алгоритмической биотехнологии» -
Михаил Петрович Райко
кандидат биологических наук, постдок, Калифорнийский университет в Сан-Диего -
Екатерина Николаевна Черняева
кандидат биологических наук, старший научный сотрудник Центра геномной биоинформатики им. Ф.Г. Добржанского, СПбГУ -
Николай Иванович Вяххи
директор Института биоинформатики, Санкт-Петербург -
Павел Владимирович Добрынин
младший научный сотрудник Центра геномной биоинформатики им. Ф. Г. Добржанского, СПбГУ